实验室主任和副主任负责拟定实验室短期及中长期建设规划，并组织实施实验室人才队伍、科研平台、科研团队等的建设；实验室研究团队的管理，规范和促进实验室的科学研究及社会服务；监管实验室经费使用；负责实验室对外联系，促进实验室的对外合作与交流；组织实施实验室科研团队及工作人员的年度和聘期考核。

实验室主任办公会是对实验室发展规划及日常运行管理中各重要事项的决策制度，也是实验室向学术委员会和依托单位提交重大议案的主要途径。

主要负责实验室各项日常事务；监督和定期检查实验室主任办公会、学术委员会会议的决议执行情况；与省科技厅和依托单位的对接，相关材料的撰写和报送；科研人员、项目成果、学术会议、研究工作报告等档案管理和图书资料管理；信息系统和网页的建设、管理与维护；专业和通用实验室、生态实验园、野外生态站的建设和管理；仪器设备申报、管理及维修；“岷山生态论坛”管理。